Dự án Kênh Tham Lương - Bến Cát - Rạch Nước Lên vẫn đang được triển khai thực hiện theo đúng kế hoạch, tuy nhiên có một số khó khăn, vướng mắc về ranh dự án, công tác thu hồi mặt bằng ở một số quận như Bình Thạnh, Bình Tân, Tân Bình, Gò Vấp, Quận 12 và huyện Bình Chánh; một số khó khăn, vướng mắc về pháp lý bãi tiếp nhận đất, bùn trong quá trình thi công; thiếu nguồn vật liệu cát san lấp, cát xây dựng...